04 diciembre, 2008

Curso Introducción a la Bioinformática

Curso
Introducción a la Bioinformática:
Análisis de Secuencias
INSCRIPCIONES

Para inscribirse, primero se debe solicitar la ficha de inscripción a biounalm@yahoo.com, la cual debe ser llenada y reenviada al mismo correo adjuntando el Voucher de pago.

* Solo se enviará la ficha de inscripción con el número de la Cta Corriente, sólo si hay vacantes disponibles.

COSTOS

Antes del 31 de Diciembre del 2008
Alumnos de la UNALM S/.100
Alumnos de otras Universidades S/.110
Profesionales S/.130

Después del 31 de Diciembre del 2008

Alumnos de la UNALM S/.110
Alumnos de otras Universidades S/.120
Profesionales S/.150

JUSTIFICACIÓN

Una de las herramientas más formidables de los últimos 20 años en el ámbito del desarrollo tecnológico, ha sido el surgimiento de la Bioinformática, la cual reúne los conocimientos de la Informática Moderna con la utilización que ellos tienen en el análisis de macromoléculas biológicas, secuencias genéticas y proteicas.

Así el estudio de las características de una proteína involucran ahora, la predicción de sus posibles funciones en base al análisis de sus secuencias y del mismo modo, las propiedades de nuevos genomas y sus variaciones pueden ser evaluadas con mucha precisión empleando una serie de programas computacionales creados con estos fines.

El descubrimiento de nuevas especies en base al conocimiento de sus genomas, el estudio de enfermedades hereditarias y el desarrollo de las terapias génicas son algunas de las aplicaciones de esta nueva área de la biología moderna.

La Bioinformática se ha convertido en uno de los factores de desarrollo en los países de Europa, Japón y EEUU ya que ellos han logrado el manejo de estas tecnologías. Por ello es necesario que nuestro país, siendo un territorio de rica diversidad biológica, se involucre profundamente en esta ciencia.

La Agrupación BioUnalm, conciente de la importancia de esta herramienta dentro de nuestro desarrollo profesional, sobre todo en el área de la biotecnología, toma este reto en base a las premisas señaladas.

OBJETIVOS

• Proporcionar una visión funcional de las diferentes áreas en que tiene presencia la Bioinformática.
• Conocer los tipos de herramientas y las estrategias generales de investigación usadas más frecuentemente en Bioinformática.
• Fomentar el aprendizaje y desarrollo de la Bioinformática.
• Desarrollar ejemplos que permitan el uso de recursos distribuidos para la solución de problemas en bioinformática con las herramientas consideradas.
• Suministrar una perspectiva de las líneas de actuación futura en este campo para el desarrollo de trabajos de investigación y tesis.

DURACIÓN DEL CURSO

El curso tendrá una duración de 24 horas teórico-prácticas, distribuido en 8 clases de 3 horas, 3 veces por semana. El curso se llevará a cabo del 26 de Enero al 11 de Febrero.

PÚBLICO OBJETIVO
Estudiantes, investigadores y profesionales de las áreas de Biología, Química, Medicina, Microbiología, Matemáticas, Informática y afines.

CONOCIMIENTOS REQUERIDOS

Los participantes deberán tener familiarización con el uso de computadoras e Internet, así como conocimientos de Bioquímica y Biología Molecular.

LUGAR

Universidad Nacional Agraria La Molina.

HORARIO

Las clases serán dictadas los días Lunes, Miércoles y VIERNES, de 4.00 a 7.00pm

CONTENIDO DEL CURSO
Clase 1

Introducción general.
Actividad: Identificar y descargar referencias bibliográficas
Bancos de Datos Biológicos I: NCBI (genbank), EMBL.
Herramientas: DNAwin
Actividad: Identificar y descargar secuencias de ADN y proteína
Bancos de Datos Biológicos II: Swissprot.
Herramientas: Swissprot proteomic tools
Actividad: Predicción de péptido señal, PM, PI, localización celular

Clase 2

Bancos de Datos Biológicos III: Protein Data Bank.
Herramientas: SwissPdbviewer
Actividad: Alineamiento estructural, mutagénesis dirigida
Bancos de Datos Biológicos IV: Drug Data Bank.
Herramientas: SwissPdbviewer, Servidores de protonación, STATA
Actividad: Determinación de la estabilidad de proteínas; determinación de la varianza posicional.

Clase 3

Alineamiento simple de secuencias I: Matrices de transición.
Herramientas: Clustal
Actividad: Identificación de dominios similares, similitud global y polimorfismos de secuencias

Clase 4

Alineamiento simple de secuencias II: Alineamiento global vs. Local.
Herramientas: Clustal, Macaw, Servidores de alineamiento en línea.
Actividad: Identificación de dominios similares, similitud global y polimorfismos de secuencias

Clase 5

Alineamiento múltiple de secuencias.
Herramientas: Clustal, Macaw, Servidores de alineamiento en línea
Actividad: Identificación de secuencias cercanas y distantes. Identificación de dominios comunes similares y de secuencias blanco para primers.

Clase 6

Alineamiento matricial
Herramientas: DotPlot
Actividad: Identificación de estructura secundaria, y secuencias repetitivas (zonas de baja complejidad)

Clase 7

BLAST: Búsqueda de secuencias similares
Herramientas: NCBI BLAST (blastn, blastp, blastx, etc.)
Actividad: Identificación de dominios y secuencias homólogas en distintas especies

Clase 8

Análisis de genomas. Bases de datos de genomas.
Herramientas: NCBI base de datos de genomas, COG (cluster of orthologous genes), TaxPlot
Actividad: Secuencias únicas y repetitivas. Manejo del servidor TaxPlot, COG. Código genético (universal y particular). Transcripción y traducción, ORF, intrones cDNA.

INSTRUCTORES

El curso será dictado por investigadores de la Unidad de Bioinformática y Biología Computacional de la Universidad Peruana Cayetano Heredia.

VACANTES LIMITADAS¡¡¡¡¡

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